88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3367 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3367  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0129  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  41.71 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1723  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  47.06 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00467009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2593  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  44.79 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480245  normal  0.0803761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1594  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  40.99 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4747  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  42.36 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331023  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3106  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  38.51 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0203731  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0234  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  37.06 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.224777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2478  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.11 
 
 		 177 aa  87.8  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0485  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  36.17 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.598438  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2137  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.17 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103028  normal  0.59177 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2410  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.88 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.932493  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5743  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component (dctQ subunit)  31.33 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.991204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.61 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7435  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.82 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0899  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6027  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0227633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5662  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.59 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.652959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07670  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  27.89 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1050  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  28 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6517  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.08 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0343  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.19 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3875  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.66 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4869  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.24 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120214  normal  0.368894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5884  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.92 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1797  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ (4TM)subunit  25.52 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107972  hitchhiker  0.000251501 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6124  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.92 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0246328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.47 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0386  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.19 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5980  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.05 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223945  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1382  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.86 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000585397  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2497  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.03 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1686  TRAP transporter DctQ-like membrane protein  27.03 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00716632  normal  0.0339689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2400  TRAP transporter, DctQ-like membrane protein  27.03 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000887899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1168  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  28.19 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.361729  normal  0.0264613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1202  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.19 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4243  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.63 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3455  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.63 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0957  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.614161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0408  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.89 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2862  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  35.71 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.779712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3965  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  41.94 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3078  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  27.61 
 
 		 632 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1186  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.14 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00496459  normal  0.115693 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3543  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.37 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.186116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3687  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  36.89 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2910  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1539  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  39.47 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0520  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.03 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5667  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  25.9 
 
 		 622 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0544  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.93 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.557919  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4819  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  35.56 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.83 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2953  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4769  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1267  aspartate kinase, monofunctional class  27.41 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.457772  normal  0.0118778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2136  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.9 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.43 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0619  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  29.9 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0785  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.98 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6142  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  29.03 
 
 		 619 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.66 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4045  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.71 
 
 		 158 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.918417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2721  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  26.9 
 
 		 627 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4386  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  28.69 
 
 		 628 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1068  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.57 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1113  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.7 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1841  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.3 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00146422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2741  TRAP C4-dicarboxylate transport system permease DctM subunit  23.97 
 
 		 626 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359375  normal  0.0328397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2977  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  41.18 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.329159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4095  TRAP-type C4-dicarboxylate transporter small and large permease  27.35 
 
 		 628 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0585194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5222  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.27 
 
 		 634 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1549  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component-like  24.49 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3302  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.97 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0771  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.7 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3452  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.37 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.49 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.87 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2685  TrapT dctQ-M fusion permease, dicarboxylate transport  26.62 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0606  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.86 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1427  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.93 
 
 		 214 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000465338  normal  0.728772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.67 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.67 
 
 		 241 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4967  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.57 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0585  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  25.29 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0089  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.31 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1362  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.93 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0803937  normal  0.0447503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1415  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.93 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.622021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>