More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001395 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  57.42 
 
 		 1047 aa  1248    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  57.51 
 
 		 1047 aa  1249    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 		 1034 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  48.47 
 
 		 1045 aa  1004    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  36.16 
 
 		 1034 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.2 
 
 		 1053 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  56.31 
 
 		 1047 aa  1235    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.62 
 
 		 1052 aa  1283    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  59.67 
 
 		 1068 aa  1281    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.7 
 
 		 1032 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.13 
 
 		 1033 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.3 
 
 		 1066 aa  1170    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  65.74 
 
 		 1056 aa  1441    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  61.6 
 
 		 1047 aa  1333    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.36 
 
 		 1064 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  48.08 
 
 		 1046 aa  964    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 		 1066 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  70.04 
 
 		 1052 aa  1483    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  36.4 
 
 		 1075 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  57.12 
 
 		 1045 aa  1241    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  57.85 
 
 		 1045 aa  1241    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.88 
 
 		 1053 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  59.46 
 
 		 1070 aa  1272    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.57 
 
 		 1077 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  49.67 
 
 		 1047 aa  1060    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.09 
 
 		 1049 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.54 
 
 		 1052 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.24 
 
 		 1049 aa  682    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  48.37 
 
 		 1045 aa  1007    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  57.62 
 
 		 1045 aa  1264    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  55.53 
 
 		 1051 aa  1172    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  55.2 
 
 		 1044 aa  1153    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.76 
 
 		 1070 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  56.91 
 
 		 1048 aa  1241    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.91 
 
 		 1075 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.91 
 
 		 1059 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  60.84 
 
 		 1060 aa  1310    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  57.52 
 
 		 1045 aa  1259    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  54.91 
 
 		 1058 aa  1138    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  59.77 
 
 		 1070 aa  1268    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.45 
 
 		 1077 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  57.43 
 
 		 1045 aa  1248    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  60.13 
 
 		 1068 aa  1275    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  60.86 
 
 		 1039 aa  1322    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.57 
 
 		 1067 aa  1235    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.19 
 
 		 1074 aa  1059    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  60.42 
 
 		 1056 aa  1321    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.72 
 
 		 1050 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  56.17 
 
 		 1074 aa  1227    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  48.75 
 
 		 1045 aa  1023    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  73.24 
 
 		 1042 aa  1569    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.23 
 
 		 1065 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  58.33 
 
 		 1054 aa  1207    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.31 
 
 		 1064 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.99 
 
 		 1046 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  45.89 
 
 		 1015 aa  900    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 		 1040 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  51.53 
 
 		 1059 aa  1099    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1070 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.37 
 
 		 1455 aa  647    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.07 
 
 		 1077 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.98 
 
 		 1049 aa  922    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  46.32 
 
 		 1094 aa  959    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  54.07 
 
 		 1051 aa  1125    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  56.25 
 
 		 1043 aa  1184    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  71.29 
 
 		 1039 aa  1524    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  35.19 
 
 		 1043 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  47.23 
 
 		 1091 aa  986    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  68.3 
 
 		 1042 aa  1438    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  54.73 
 
 		 1052 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.56 
 
 		 1031 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.35 
 
 		 1040 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  36.91 
 
 		 1070 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  61.87 
 
 		 1056 aa  1331    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.7 
 
 		 1083 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  52.79 
 
 		 1061 aa  1106    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  55.74 
 
 		 1042 aa  1210    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.68 
 
 		 1066 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  55.07 
 
 		 1043 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  34.83 
 
 		 1070 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  58.69 
 
 		 1048 aa  1251    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  55.32 
 
 		 1060 aa  1146    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  56.55 
 
 		 1065 aa  1159    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.83 
 
 		 1069 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  36.65 
 
 		 1035 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  55.65 
 
 		 1060 aa  1152    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  47.22 
 
 		 1100 aa  958    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  60.66 
 
 		 1056 aa  1321    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  36.49 
 
 		 1023 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.54 
 
 		 1043 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  60.82 
 
 		 1055 aa  1330    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  57.79 
 
 		 1044 aa  1233    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  57.09 
 
 		 1044 aa  1222    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  58.78 
 
 		 1047 aa  1286    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 		 1070 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  60.13 
 
 		 1068 aa  1275    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.36 
 
 		 1062 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  65.99 
 
 		 1045 aa  1437    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.25 
 
 		 1058 aa  1157    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>