259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3960 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  63.64 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  63.64 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  63.64 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  57.14 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  55.19 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  53.9 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  58.33 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  49.35 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  51.3 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  48.05 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  51.3 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  51.66 
 
 		 184 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  51.95 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  54.05 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  48.7 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  49.35 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  51.95 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  44.22 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  44.81 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  46.58 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  39.61 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  48.68 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  43.36 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  38.41 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  45.16 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.13 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.06 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  35.1 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  41.1 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  38.31 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  36.99 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40.52 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  42.18 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.66 
 
 		 513 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  36 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  36.42 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  40.52 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  41.56 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  38.46 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  39.33 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  38.46 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  34.84 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  38.67 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  36.99 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  36.42 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  34.67 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  35.33 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  35.62 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  40.27 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  38.41 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.73 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.69 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  41.26 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  35.33 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  42.66 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.76 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  36.42 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.56 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.62 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  39.46 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  40.56 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  40.56 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  35.48 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  35.48 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.48 
 
 		 149 aa  87.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  34.64 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  38.89 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38.36 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  33.1 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  34.25 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  33.12 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  38.36 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  32.67 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  36.05 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  35.17 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  40.69 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  35.62 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>