256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4729 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  285  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  69.59 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  62 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  59.06 
 
 		 149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  52.35 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  51.01 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  51.75 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  47.3 
 
 		 513 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  46 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  51.02 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  42.38 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  44.97 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  45.39 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  38.41 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.07 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  41.45 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  43.24 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  42.57 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.38 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  37.75 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  41.89 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  36.81 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.72 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  38.46 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  38.46 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  41.18 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  39.6 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40.94 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.5 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.46 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  40.27 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  43.05 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  39.74 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  39.74 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  39.74 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  36 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  42.28 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  37.16 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  39.07 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40.14 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  42.57 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.3 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.95 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.9 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  43.38 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  36.91 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  39.46 
 
 		 167 aa  94  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  36.18 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  35.57 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.14 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.38 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  36.91 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.48 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  40.4 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  33.78 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.33 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>