259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0194 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  288  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  81.33 
 
 
154 aa  242  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  68 
 
 
167 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  63.33 
 
 
150 aa  176  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  60.26 
 
 
151 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  68 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  57.79 
 
 
155 aa  157  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  57.62 
 
 
152 aa  150  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  55.63 
 
 
150 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  58.67 
 
 
152 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  58.55 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  54.67 
 
 
150 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  59.73 
 
 
155 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  47.92 
 
 
149 aa  134  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.92 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  54.9 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  44 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  49.66 
 
 
150 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  45.58 
 
 
146 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  48.3 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  47.97 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  49.67 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  48.7 
 
 
154 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  45.27 
 
 
147 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  48.7 
 
 
154 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  47.68 
 
 
149 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  47.3 
 
 
147 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  43.33 
 
 
151 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 
145 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  47.3 
 
 
149 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  50.33 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  42.38 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  46.62 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  47.06 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  43.05 
 
 
513 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  41.72 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  40.41 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  45.64 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.92 
 
 
148 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  44.12 
 
 
147 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  44.9 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  44.22 
 
 
147 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  41.96 
 
 
150 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  45.27 
 
 
147 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  42.28 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  42.28 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  40.54 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  43.92 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  42.28 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  52.6 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  43.84 
 
 
148 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  43.84 
 
 
148 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  43.92 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  41.72 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  43.24 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  42.07 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  43.62 
 
 
148 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  40.82 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  43.62 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 
149 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  43.62 
 
 
150 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.95 
 
 
149 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  47.33 
 
 
157 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 
149 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 
149 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  103  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  42.07 
 
 
143 aa  103  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  42.57 
 
 
148 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 
149 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 
148 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  37.41 
 
 
146 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 
149 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.54 
 
 
149 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  44.81 
 
 
154 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.61 
 
 
148 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 
148 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  41.56 
 
 
154 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 
148 aa  100  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  36.91 
 
 
148 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  33.77 
 
 
149 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 
149 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>