257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0510 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  279  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  67.11 
 
 
150 aa  178  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  61.07 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  63.09 
 
 
154 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  68.46 
 
 
155 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  57.72 
 
 
167 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  60.53 
 
 
154 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  57.14 
 
 
155 aa  148  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  56 
 
 
151 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  55.03 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  60.4 
 
 
152 aa  144  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  57.33 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  60.78 
 
 
155 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  49.35 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  54.67 
 
 
184 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  55.03 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  53.69 
 
 
150 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  51.95 
 
 
154 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  51.95 
 
 
154 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  51.95 
 
 
154 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  50.68 
 
 
152 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  50.69 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.47 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  48.61 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  44 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  44.22 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.37 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.06 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  42.47 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  43.54 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  39.04 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  39.73 
 
 
147 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  51.92 
 
 
160 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.1 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 
148 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 
147 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 
150 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  44.52 
 
 
154 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  32.62 
 
 
149 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.47 
 
 
149 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  33.1 
 
 
149 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36 
 
 
148 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.22 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  37.67 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  44.59 
 
 
152 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  33.78 
 
 
149 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  35.76 
 
 
151 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.49 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  36.67 
 
 
513 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  32.41 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.01 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  36.55 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  36.55 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.3 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  36.55 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  36.17 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  60.4 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.26 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  61.74 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  34.01 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  42.47 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  34.53 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  40.29 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  37.16 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  37.76 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  32.37 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  41.1 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  41.1 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  36.99 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.18 
 
 
148 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  35.53 
 
 
149 aa  94  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.1 
 
 
151 aa  93.2  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  35.56 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>