255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0349 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  296  6e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  95.3 
 
 
149 aa  282  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  94.63 
 
 
149 aa  278  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  45.95 
 
 
148 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  44.97 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  45.14 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  42.96 
 
 
147 aa  129  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  45.14 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  45.14 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  43.45 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.18 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  123  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  46.1 
 
 
147 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  44.14 
 
 
147 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  45.39 
 
 
147 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  45.39 
 
 
147 aa  120  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.58 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  41.67 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
149 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  45.07 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  44.22 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
149 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  43.66 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  40.71 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  39.58 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  41.55 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  39.73 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.62 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  38.62 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  110  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.72 
 
 
147 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.41 
 
 
150 aa  110  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  37.14 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  39.31 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  38.62 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.58 
 
 
156 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  38.89 
 
 
513 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.35 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  35.71 
 
 
146 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  36.55 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  39.31 
 
 
147 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  41.78 
 
 
148 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  35.66 
 
 
148 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  39.52 
 
 
151 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  40.4 
 
 
152 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  40.4 
 
 
152 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  36.81 
 
 
147 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 
148 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  40.56 
 
 
149 aa  102  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  37.67 
 
 
148 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  36.88 
 
 
148 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  38 
 
 
152 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  35.86 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  37.93 
 
 
151 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  35.86 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  37.33 
 
 
152 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  37.93 
 
 
148 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 
148 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
148 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  36.05 
 
 
148 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  34.48 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  34.93 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  34.93 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  34.93 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  34.01 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  37.76 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>