257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1043 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  289  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  49.66 
 
 
147 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  48.28 
 
 
147 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  44.83 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.97 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  44.14 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  114  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  44.3 
 
 
148 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  42.76 
 
 
146 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  45.14 
 
 
147 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
149 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  45.14 
 
 
147 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  40.69 
 
 
147 aa  105  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  42.03 
 
 
147 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  41.84 
 
 
167 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.69 
 
 
149 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.69 
 
 
149 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  42.36 
 
 
147 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.26 
 
 
151 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40.82 
 
 
150 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  42.07 
 
 
148 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 
145 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  44.3 
 
 
150 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  37.24 
 
 
146 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
148 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  44 
 
 
153 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  35.86 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 
149 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  40 
 
 
148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.04 
 
 
147 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  38.73 
 
 
147 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36.49 
 
 
148 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.26 
 
 
149 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  100  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  38.36 
 
 
147 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  41.13 
 
 
151 aa  100  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  42.07 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.72 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  42.75 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36.17 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  38.62 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  37.24 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  41.33 
 
 
153 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  40.85 
 
 
148 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  39.39 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  39.31 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  39.39 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.03 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  38.81 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  42.55 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  38.03 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.88 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  37.93 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  39.86 
 
 
513 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  38.62 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  35.37 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.93 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  38.1 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  35.37 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  41.67 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  41.67 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.6 
 
 
157 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  34.01 
 
 
152 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  37.24 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  35.86 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  35.86 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  35.86 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  37.93 
 
 
147 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>