255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0933 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  100 
 
 		 147 aa  286  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  69.18 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  69.18 
 
 		 147 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  58.5 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  51.7 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  48.97 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  48.98 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  48.28 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  45.58 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  49.53 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.04 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.73 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  37.67 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  36.73 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.99 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.04 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  53.68 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  36.99 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  51.04 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  34.93 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  34.25 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  93.2  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  32.88 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  43.44 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  43.44 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  34.69 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  35.17 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  34.03 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  33.79 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  34.69 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  34.69 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  34.69 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  46.88 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  32.65 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  46.88 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  37.84 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  46.88 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.86 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  34.69 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  34.93 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  36.73 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  34.87 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  47.92 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  35.37 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  36.89 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  40.14 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  45.83 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  45.83 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  33.1 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  36.05 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  46.32 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  37.7 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  37.7 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  32.89 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  32.24 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>