258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0788 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  286  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  61.11 
 
 
143 aa  149  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  52.38 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  51.02 
 
 
149 aa  142  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  46.62 
 
 
147 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 
148 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  41.5 
 
 
148 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  120  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  48.3 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  47.62 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  41.61 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  44.37 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  42.57 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  44.37 
 
 
513 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  45.7 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
147 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  42.18 
 
 
149 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  42.67 
 
 
150 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
149 aa  110  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  48.98 
 
 
151 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  43.79 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.22 
 
 
149 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.51 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  40.67 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.1 
 
 
146 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.19 
 
 
147 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  37.76 
 
 
147 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  40.4 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  40 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  38.51 
 
 
147 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  39.86 
 
 
149 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  39.86 
 
 
149 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.78 
 
 
151 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  42.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  40.82 
 
 
143 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  43.42 
 
 
152 aa  104  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  43.05 
 
 
152 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  43.79 
 
 
153 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 
148 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  39.86 
 
 
147 aa  103  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  41.22 
 
 
147 aa  103  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 
149 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  42.18 
 
 
167 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 
154 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 
148 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  45.95 
 
 
148 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  42.47 
 
 
146 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.92 
 
 
148 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  36.99 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.41 
 
 
149 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  40.27 
 
 
149 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  43.15 
 
 
150 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  41.22 
 
 
148 aa  100  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  40.54 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.24 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  41.61 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  39.74 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  37.06 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.26 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  37.58 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.92 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  41.22 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 
152 aa  97.1  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  38.16 
 
 
154 aa  96.7  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  41.18 
 
 
184 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  45.27 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
178 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  41.5 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  39.86 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1869  GatB/YqeY domain-containing protein  32.78 
 
 
183 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.329708  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  34.12 
 
 
173 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  39.04 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>