266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0729 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  56.38 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  55.41 
 
 		 148 aa  166  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  53.06 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  52.38 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  52.38 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  51.02 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  50 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  52.82 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  44.9 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  41.96 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  44.3 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  42.96 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  41.1 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  41.61 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.4 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42.07 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  42.07 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.31 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  41.78 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.47 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  37.41 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  39.19 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.99 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  38.03 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.3 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  38.41 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  39.46 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  36.73 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  36.24 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  34.25 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.51 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  35.62 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  34.25 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.05 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  37.5 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  35.37 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  36.99 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.57 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  35.57 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  37.98 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  35.81 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  36.88 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  36.91 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  36.17 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  35.37 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  35.37 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  38.67 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  34.25 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  34.25 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  35.62 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>