258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1959 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  100 
 
 
147 aa  283  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  76.19 
 
 
143 aa  212  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  56.46 
 
 
148 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  58.22 
 
 
147 aa  167  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  57.53 
 
 
147 aa  166  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  59.31 
 
 
146 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  51.7 
 
 
147 aa  150  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  48.3 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  46.58 
 
 
149 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  46.62 
 
 
147 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  45.89 
 
 
149 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
148 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  43.54 
 
 
148 aa  117  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  39.04 
 
 
150 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  42.95 
 
 
149 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  114  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  37.41 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  41.33 
 
 
151 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  44.97 
 
 
151 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  43.54 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  41.72 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  41.61 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  37.67 
 
 
147 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  41.72 
 
 
151 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  40.82 
 
 
148 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 
153 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  42.75 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  43.24 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  40.94 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  42.18 
 
 
149 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  38.36 
 
 
148 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  41.72 
 
 
157 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  42.03 
 
 
148 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  37.67 
 
 
149 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 
149 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
149 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  44 
 
 
513 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  43.07 
 
 
148 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  38.85 
 
 
148 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.04 
 
 
149 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
148 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
148 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  40.14 
 
 
148 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  41.22 
 
 
150 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  42.28 
 
 
151 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.31 
 
 
151 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.36 
 
 
147 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 
149 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 
149 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 
148 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  38.93 
 
 
150 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.36 
 
 
149 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  36.24 
 
 
150 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 
152 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.58 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  36.05 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.91 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  36.05 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  39.16 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  40.52 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  38.26 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  38.1 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  39.85 
 
 
149 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  36.73 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  36.73 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  39.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  44.3 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  38.41 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  39.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.16 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  39.46 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>