259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0459 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  100 
 
 
154 aa  298  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  81.33 
 
 
151 aa  242  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  67.33 
 
 
150 aa  191  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  64 
 
 
151 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  72.19 
 
 
155 aa  180  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  64 
 
 
167 aa  176  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  61.94 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  63.09 
 
 
150 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  56.95 
 
 
152 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  59.48 
 
 
154 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  61.18 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  56 
 
 
152 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  54.67 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  51.33 
 
 
150 aa  140  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  54.3 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  48.05 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  48.3 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  50.65 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  50.65 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  50.65 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  46.31 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  53.29 
 
 
184 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  45.58 
 
 
147 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  48.34 
 
 
152 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.3 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  40.4 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  44.9 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  42.57 
 
 
147 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.9 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.28 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  44.22 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.28 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 
147 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  48.05 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  42.38 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  43.24 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  43.24 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  39.04 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  43.14 
 
 
152 aa  107  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  52.63 
 
 
160 aa  107  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  42.18 
 
 
147 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  43.62 
 
 
143 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  41.5 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  44.06 
 
 
147 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 
147 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.82 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 
147 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  40.79 
 
 
153 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.61 
 
 
150 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  37.58 
 
 
150 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  43.42 
 
 
149 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
149 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.33 
 
 
513 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 
152 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 
148 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  42.18 
 
 
147 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  41.89 
 
 
148 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  56.56 
 
 
151 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  35.33 
 
 
149 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  35.33 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  38.36 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  39.46 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  39.46 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  35.33 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  37.58 
 
 
148 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  36.24 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  37.58 
 
 
148 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  42.11 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  44 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  44.59 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  44.59 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>