258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18460 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  296  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  66.23 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  62.5 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  48.34 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  50.33 
 
 
150 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  45.58 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  47.68 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  46.21 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  51.75 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  47.65 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 
149 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  50.69 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  45.1 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.1 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.33 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  44.67 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  40.26 
 
 
153 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  43.71 
 
 
151 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  37.33 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  48.98 
 
 
155 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.48 
 
 
149 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40 
 
 
146 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  44.52 
 
 
154 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36 
 
 
147 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
149 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  42.67 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  46.62 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  45.33 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.1 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  45.33 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  45.33 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.16 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.5 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.5 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  40.41 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  48.7 
 
 
160 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  44.23 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  38.78 
 
 
152 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  39.47 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  40.79 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.67 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  38.41 
 
 
513 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  39.46 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  35.53 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  33.33 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  32.41 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  35.33 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  32.67 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  34 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  34.67 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  32.67 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36 
 
 
147 aa  87  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  35.53 
 
 
148 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  35.29 
 
 
148 aa  87  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  35.81 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  33.77 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  36.18 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  36.18 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.3 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.18 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  38.35 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  35.33 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  36.84 
 
 
148 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.33 
 
 
147 aa  84.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  38.56 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  37.33 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  36.05 
 
 
146 aa  84  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  35.33 
 
 
147 aa  84  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  33.56 
 
 
149 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  35.33 
 
 
152 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  38.96 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  35.33 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  37.93 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  35.33 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  35.33 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  34.67 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  29.66 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>