257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0497 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  100 
 
 
148 aa  295  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  72.6 
 
 
149 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  65.07 
 
 
151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  59.18 
 
 
178 aa  173  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  57.43 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  51.7 
 
 
149 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  50 
 
 
149 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  50 
 
 
149 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  49.32 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  44.3 
 
 
150 aa  123  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42.07 
 
 
146 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 
147 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 
147 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 
147 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.45 
 
 
146 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  120  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  46.62 
 
 
148 aa  120  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  45.58 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  45.52 
 
 
150 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.92 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  45.7 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  40.56 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  43.92 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  46.21 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  46.15 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.47 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  44.59 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.67 
 
 
151 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.78 
 
 
150 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  40.79 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  43.92 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  43.05 
 
 
513 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.78 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  44 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.13 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  44.59 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  43.28 
 
 
148 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  44.22 
 
 
149 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  35.81 
 
 
148 aa  107  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  41.5 
 
 
148 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  41.5 
 
 
148 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
152 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  42.57 
 
 
152 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
151 aa  104  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  46.26 
 
 
148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 
150 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.89 
 
 
152 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  46.58 
 
 
148 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  44.9 
 
 
148 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 
151 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.58 
 
 
156 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.62 
 
 
148 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  45.58 
 
 
148 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.07 
 
 
152 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  38.82 
 
 
152 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  45.89 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  45.58 
 
 
148 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  39.47 
 
 
151 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  37.24 
 
 
149 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
147 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  42.48 
 
 
153 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 
149 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.73 
 
 
147 aa  100  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  46.62 
 
 
148 aa  100  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.36 
 
 
147 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  40.41 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>