259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1512 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  42.18 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
148 aa  124  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.1 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  46.15 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.01 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  43.24 
 
 
158 aa  114  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  38.62 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  40.4 
 
 
152 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
148 aa  110  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.18 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  42.96 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  41.78 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  41.78 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  46.15 
 
 
151 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  39.19 
 
 
149 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.15 
 
 
148 aa  107  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  46.72 
 
 
151 aa  107  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  40.41 
 
 
148 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  37.32 
 
 
147 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  36.62 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  36.62 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  38.36 
 
 
148 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  35.37 
 
 
147 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 
147 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  36.62 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  39.72 
 
 
152 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  36.88 
 
 
146 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  42.96 
 
 
146 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  44.59 
 
 
151 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  45.83 
 
 
167 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42.25 
 
 
146 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  41.22 
 
 
150 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  103  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  41.1 
 
 
149 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  36.3 
 
 
147 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0807  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  103  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 
152 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  102  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.73 
 
 
150 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  34.04 
 
 
145 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  40 
 
 
149 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 
149 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  34.93 
 
 
147 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.21 
 
 
150 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  38.93 
 
 
152 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  36.62 
 
 
146 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
147 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  100  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.35 
 
 
147 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.25 
 
 
148 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  34.93 
 
 
147 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  32.65 
 
 
147 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  41.38 
 
 
153 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  36.62 
 
 
147 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  39.47 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  36.99 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  36.99 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  39.31 
 
 
150 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  36.99 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  41.1 
 
 
152 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.3 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  46.4 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  36.3 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  32.19 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  34.51 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  36.55 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.55 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>