256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0932 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  100 
 
 		 152 aa  296  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  75.5 
 
 		 152 aa  229  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  78.29 
 
 		 152 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  74.67 
 
 		 152 aa  223  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  72.19 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  66.89 
 
 		 152 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  62.25 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  52.7 
 
 		 513 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  50.99 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  42.38 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  43.33 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  42.38 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  43.05 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  41.72 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  44 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  40.67 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  41.18 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  39.74 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  39.74 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  39.33 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  37.75 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  41.61 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  41.72 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  37.75 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  40.27 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  40.4 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.67 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.72 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  36.42 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.71 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  36.42 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  37.75 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  33.77 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.72 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  37.09 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  42.38 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.32 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  41.33 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  39.07 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  37.75 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  42.96 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  38.16 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  40.13 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  43.62 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  41.06 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  38.41 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.07 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  36.05 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  35.53 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  35.76 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  38.82 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  34 
 
 		 153 aa  97.1  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  35.1 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  39.07 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  33.77 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.44 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  35.76 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  33.77 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  41.03 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  35.1 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  32.67 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.07 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  35.1 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  43.71 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  39.07 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  35.1 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>