255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1822 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  299  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  77.63 
 
 		 152 aa  235  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  78 
 
 		 152 aa  226  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  74.67 
 
 		 152 aa  223  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  73.33 
 
 		 151 aa  218  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  66.45 
 
 		 152 aa  204  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  62.25 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  54 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  54.67 
 
 		 513 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  50.67 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  41.33 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  41.33 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  43.92 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  44.67 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  39.33 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  40.67 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.54 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.95 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  42.95 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  35.33 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  37.75 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  38.82 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  37.33 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  37.5 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  37.09 
 
 		 147 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.67 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  38.67 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.67 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  39.07 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.47 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.19 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  38.36 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.89 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  37.33 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  39.44 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  40.67 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  38.51 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  35.81 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  39.33 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 		 178 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.67 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  35.14 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.94 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.73 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  38.82 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  37.84 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.73 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  34.87 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  39.47 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  34.23 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  35.14 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  37.5 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  42 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  35.76 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>