256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1121 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  290  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 
148 aa  166  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  54.79 
 
 
147 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  54.05 
 
 
148 aa  156  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  54.73 
 
 
149 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  52.82 
 
 
147 aa  147  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  48.63 
 
 
148 aa  147  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  52.11 
 
 
147 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  51.41 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  51.41 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  51.41 
 
 
147 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  43.97 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  47.89 
 
 
148 aa  135  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  45.03 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  47.86 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  47.3 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  42.47 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  44.83 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.67 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  40.85 
 
 
148 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  41.55 
 
 
149 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.96 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  40.69 
 
 
146 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  43.45 
 
 
149 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 
147 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 
147 aa  120  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  44.44 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  42 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  46.76 
 
 
151 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  42.38 
 
 
157 aa  117  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  42.47 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.52 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  43.71 
 
 
152 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  42.18 
 
 
151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  42.47 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.28 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  41.78 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  43.54 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  37.76 
 
 
147 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  41.89 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.55 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  42.36 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  42.36 
 
 
148 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.14 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  40.27 
 
 
147 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  40.27 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  36.91 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.04 
 
 
152 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  34.93 
 
 
149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.04 
 
 
147 aa  104  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  34.93 
 
 
149 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
147 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  40.41 
 
 
147 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  41.61 
 
 
153 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  34.93 
 
 
149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.81 
 
 
149 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 
149 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 
149 aa  103  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  39.55 
 
 
152 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  38.36 
 
 
152 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 
148 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 
149 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  43.75 
 
 
150 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.73 
 
 
152 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.85 
 
 
151 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.04 
 
 
149 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
148 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.19 
 
 
148 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  37.24 
 
 
156 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  38.78 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  39.31 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.03 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  35.37 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>