258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1384 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  63.76 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  65.1 
 
 		 149 aa  180  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  59.06 
 
 		 149 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  57.72 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  54.67 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  54.05 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  57.55 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  58.99 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  50.99 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  47.02 
 
 		 151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  46.67 
 
 		 513 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  42.95 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  43.71 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  42.95 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  43.62 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  41.06 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  44.3 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  42.95 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.72 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  43.45 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  40.94 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  39.6 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  106  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.5 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  42.21 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  42.38 
 
 		 152 aa  103  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  39.19 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  39.86 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.95 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  43.88 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.58 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  41.01 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  40.13 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  40.27 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  41.61 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  40.94 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.16 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  35.57 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.65 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  39.74 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  38.26 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.47 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  40.67 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.3 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  39.6 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  39.74 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.16 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  40.27 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.46 
 
 		 150 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.28 
 
 		 148 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  39.74 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  41.61 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  35.57 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  40.94 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  34.46 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40.4 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.24 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  37.06 
 
 		 173 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  39.31 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  39.31 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  39.31 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  39.31 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.49 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.23 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  35.86 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  41.38 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  42.95 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>