253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0980 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  58.99 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  55.1 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  57.64 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  56.55 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  52.05 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  51.05 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  51.02 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  48.25 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  45.45 
 
 		 513 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  40.67 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  37.16 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.51 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  41.22 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  42.14 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.99 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  43.14 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  37.67 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  42.48 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.16 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  38.85 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  35.62 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.33 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  41.43 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  36.18 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.04 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36.88 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  41.83 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.24 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  37.32 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  35.86 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.97 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  37.24 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  36.88 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  36.3 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  38.93 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  39.42 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  38.26 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  35.21 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.58 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  38.62 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  38.19 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.44 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.99 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  35.29 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  35.37 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  37.16 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.33 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  35.46 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  32.86 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  37.24 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  33.99 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  36.43 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  40 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  32.21 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  34.93 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  34.48 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>