258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6790 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  297  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  80.79 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  77.33 
 
 		 152 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  237  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  80.79 
 
 		 151 aa  235  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  75.33 
 
 		 151 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  76.82 
 
 		 151 aa  216  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  59.33 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  58.28 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  56.95 
 
 		 152 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  56.95 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  166  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  50.68 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  54 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  57.33 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  59.6 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  52 
 
 		 154 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  59.6 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  48.67 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  52.35 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  48.67 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  44.3 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  47.33 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  48 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  52.35 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  51.68 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  55.03 
 
 		 152 aa  137  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  52.35 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  52.32 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  50.7 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  45.71 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  44.3 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  44.3 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  46.98 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  43.62 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  42.28 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.33 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  42.95 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  41.61 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.33 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  46.62 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  47.65 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  42.67 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  45.03 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.28 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  41.56 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  42.67 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  45.64 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  43.33 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  43.24 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  44.97 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  39.33 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.14 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.27 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.27 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.89 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  44.3 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.58 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>