254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0662 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  274  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  94.37 
 
 		 152 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  94.37 
 
 		 152 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  70.42 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  64.54 
 
 		 152 aa  179  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  62.41 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  68.79 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  59.15 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  58.16 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  59.15 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  56.74 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  56.74 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  56.74 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  55.32 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  56.03 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  50.7 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  51.45 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  51.45 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  50.35 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  51.06 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  51.45 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  49.28 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  57.45 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  50.72 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  53.62 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  49.65 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  57.25 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  56.52 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  52.48 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  48.23 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  48.23 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  48.23 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  48.23 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  51.77 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  50.72 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  54.61 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  47.52 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  44.68 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  48.2 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  44.93 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  46.81 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  43.28 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  46.81 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.68 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  44.37 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  46.81 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  42.25 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  53.9 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.68 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  45 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  53.9 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  47.52 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.55 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  44.2 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  42.03 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  42.03 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  41.55 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  43.48 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  43.57 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.13 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.85 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  51.41 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  44.68 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  39.01 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.14 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  45.65 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  44.2 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  43.48 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.55 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  40.43 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40.85 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  40.43 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.03 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  45.07 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  41.13 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  47.52 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  40.56 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.13 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  39.01 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  41.73 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  43.57 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  44.68 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  39.72 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  40.43 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  38.73 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  44.2 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  39.44 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  41.55 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.58 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.73 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  45.65 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.44 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>