255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1482 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  296  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  98.67 
 
 
150 aa  292  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  92 
 
 
150 aa  255  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  62.42 
 
 
149 aa  200  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  58.39 
 
 
149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  58.39 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  56 
 
 
151 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  60.4 
 
 
153 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  51.68 
 
 
151 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  52.35 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  55.03 
 
 
154 aa  159  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  53.69 
 
 
152 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  54.36 
 
 
153 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  52.35 
 
 
152 aa  154  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  57.72 
 
 
154 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  52.35 
 
 
152 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  52.35 
 
 
152 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  49.66 
 
 
151 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  46.98 
 
 
151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  50.34 
 
 
151 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  50.67 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  51.33 
 
 
154 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  53.69 
 
 
152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 
152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  57.25 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  53.69 
 
 
152 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  48.32 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  50.34 
 
 
151 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  53.02 
 
 
152 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  52 
 
 
152 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  44 
 
 
150 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  46.98 
 
 
150 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  46.31 
 
 
151 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  50.68 
 
 
157 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  43.62 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40.15 
 
 
147 aa  111  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  42.14 
 
 
152 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 
150 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  35.81 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  35.81 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 
147 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  39.13 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  39.13 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  39.13 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  37.96 
 
 
147 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  39.13 
 
 
147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  35.81 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.26 
 
 
147 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 
148 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  37.84 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  34.46 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  36.49 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  33.78 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  33.99 
 
 
153 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.5 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  35.17 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.23 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  36.91 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  35.14 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.81 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  39.19 
 
 
148 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  36.49 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  33.78 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  34.46 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  35.14 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  36.49 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  37.58 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.96 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.23 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  34.46 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  35.81 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  39.13 
 
 
148 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  35.62 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  38.93 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  30.66 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  36.96 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>