251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2082 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  296  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  63.76 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  61.74 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  59.73 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  58.39 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  48.65 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  55.03 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  45.95 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  48.65 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  46.62 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  44.3 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  46.58 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  46.98 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  53.38 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  45.95 
 
 		 152 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  44.59 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  45.89 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  42.57 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  45.27 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  44.59 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  44.22 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  47.95 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  49.28 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  45.27 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  46.62 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  45.27 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  44.59 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  42.57 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  34.46 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  41.61 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  34.46 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  31.76 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  36.24 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.77 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  36.88 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  40.94 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  36.5 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  34.46 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  34.46 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  32.89 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  32.43 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  37.93 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  31.08 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  33.11 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  35.14 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  34.46 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  31.08 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  33.1 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  32.21 
 
 		 513 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  30.2 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  34.23 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  30.87 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  35.17 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  35.17 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  35.17 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  35.17 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  29.05 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  29.05 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  30.07 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  30.41 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  34.31 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  32.21 
 
 		 152 aa  86.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  34.67 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  32.62 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  33.09 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  32.43 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  35.71 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  30.34 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  31.08 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  31.72 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  31.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  84  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  28.37 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>