255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2884 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  295  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  60.67 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  51.32 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  53.64 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  157  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  52.67 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  50.67 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  57.33 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  53.95 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  53.29 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  55.1 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  52.63 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  55.1 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  52.98 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  52.32 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  54.67 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  45.7 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  53.69 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  54.61 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  52.32 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  57.24 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  48.67 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  47.02 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  49.67 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  56.67 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  51.33 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  48.67 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  50.34 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  48.63 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  47.26 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  47.95 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  44.97 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.33 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  45.21 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  50.67 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  45.21 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.38 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  43.62 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.52 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  47.95 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.61 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.67 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.33 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  43.71 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.06 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.4 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  42.67 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  43.62 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  43.05 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.62 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.67 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  38.67 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.6 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.6 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  38 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  37.33 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.41 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  38.26 
 
 		 513 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  39.07 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>