255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3109 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  69.33 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  69.33 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  62.84 
 
 		 149 aa  205  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  60 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  58.39 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  54.36 
 
 		 152 aa  170  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  57.33 
 
 		 151 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  57.72 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  53.69 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  53.69 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  59.06 
 
 		 150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  58.39 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  57.33 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  54 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  48.65 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  51.68 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  49.33 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  52 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  50.66 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  48.67 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  55.7 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  57.72 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  53.38 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  53.69 
 
 		 152 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  52.35 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  52.35 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  46.71 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  51.06 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  46.31 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  45.52 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.6 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  44.85 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  39.61 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.69 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  43.71 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.26 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  43.07 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.84 
 
 		 513 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.28 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.16 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  39.19 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  33.78 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.49 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  39.6 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  38.16 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  36.91 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  36.91 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  34.23 
 
 		 152 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  34.67 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  37.33 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  34.67 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  37.33 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  35.33 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  36.55 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.59 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  36.67 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  36.67 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>