256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1700 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  284  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  90.54 
 
 		 148 aa  240  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  74.15 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  73.47 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  70.95 
 
 		 148 aa  204  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  70.95 
 
 		 148 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  72.6 
 
 		 152 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  70.75 
 
 		 149 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  68.71 
 
 		 148 aa  194  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  70.27 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  72.97 
 
 		 148 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  72.97 
 
 		 148 aa  193  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  72.3 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  72.3 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  70.95 
 
 		 148 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  68.71 
 
 		 148 aa  190  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  65.07 
 
 		 148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  65.75 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  69.59 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  64.47 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  63.51 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  65.31 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  70.27 
 
 		 148 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  66.67 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  70.95 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  70.95 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  64.03 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  68.71 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  65.13 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  62.59 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  59.18 
 
 		 148 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  62.59 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  56.46 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  55.78 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  58.22 
 
 		 149 aa  166  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  63.27 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  55.78 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  58.22 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  55.86 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  53.74 
 
 		 147 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  55.78 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  52.74 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  52.74 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1387  GatB/Yqey domain-containing protein  63.16 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000956621  hitchhiker  0.00945074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  55.1 
 
 		 147 aa  153  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  50.68 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  54.11 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  52.38 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  48.65 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  53.42 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  54.11 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  50.34 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  51.72 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  50.68 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  51.03 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  143  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 		 147 aa  141  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  53.42 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  48.32 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  47.95 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  45.52 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  48.97 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  47.3 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  45.52 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  46.62 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  53.42 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  47.26 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  53.42 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  47.3 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.45 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  43.62 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  43.45 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  43.62 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  46.94 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  47.97 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  43.62 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  44.3 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  45.58 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  45.58 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  45.58 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>