258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3296 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  100 
 
 		 150 aa  291  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  80.54 
 
 		 152 aa  204  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  66.23 
 
 		 153 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  64 
 
 		 152 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  63.33 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  63.33 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  59.33 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  58.94 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  57.33 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  60.26 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  59.6 
 
 		 151 aa  167  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  60.67 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  55.33 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  54 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  54.48 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  65.33 
 
 		 152 aa  157  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  54.97 
 
 		 153 aa  156  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  62.67 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  56.29 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  146  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  51.01 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  47.02 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  54.67 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  49.32 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  52 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.59 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  48.63 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  49.66 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  51.01 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  46.67 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  45.95 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  49.33 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  46.58 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  48.92 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  42.57 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  44.9 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  44.52 
 
 		 147 aa  119  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  44.83 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  44.83 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  44.83 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  120  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  44.83 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  48.61 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  43.75 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  46.9 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  43.92 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  52.48 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  47.02 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.83 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  43.62 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.14 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.86 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  39.86 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  48.99 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  48.99 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.6 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.22 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  47.65 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  42.21 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  45.64 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  47.3 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  46.98 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.76 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  46.9 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  41.38 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  39.19 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.89 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  43.92 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.27 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  44.59 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  41.22 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0860  GatB/Yqey domain-containing protein  51.09 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  43.24 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  43.24 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>