252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3033 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  288  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  53.69 
 
 
152 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  53.69 
 
 
152 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  53.69 
 
 
152 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  52.67 
 
 
153 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  51.01 
 
 
150 aa  133  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  46.71 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  47.65 
 
 
150 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  51.66 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  47.65 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  43.62 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0860  GatB/Yqey domain-containing protein  56.93 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118849  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  45.33 
 
 
152 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  44.74 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  42.48 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  47.83 
 
 
150 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  42.57 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  43.33 
 
 
151 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  50.34 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.27 
 
 
149 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  41.33 
 
 
147 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  47.02 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  47.02 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  49.65 
 
 
142 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  48.32 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.74 
 
 
149 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  46.48 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  43.62 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.67 
 
 
149 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  38.51 
 
 
149 aa  103  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  41.45 
 
 
148 aa  103  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.67 
 
 
152 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 
148 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  42.11 
 
 
151 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 
150 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  35.33 
 
 
148 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  37.33 
 
 
152 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  39.74 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  36.42 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.22 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.87 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.67 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  43.71 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  46.43 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38.67 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.19 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  38.36 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  36.49 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.05 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  38 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  43.57 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 
152 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  40.94 
 
 
150 aa  94  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  37.58 
 
 
150 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  37.33 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  42.38 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.54 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  37.25 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  33.56 
 
 
148 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  38.03 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  35.76 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  34.67 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  36.84 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  35.57 
 
 
149 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  36.42 
 
 
151 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  38.67 
 
 
147 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  32.67 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  36.91 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  36.91 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  32 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  34.93 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  34.67 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>