256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2228 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  302  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  62.84 
 
 		 151 aa  205  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  63.76 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  61.49 
 
 		 150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  65.77 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  61.49 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  63.09 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  55.41 
 
 		 152 aa  175  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  62.42 
 
 		 150 aa  174  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  56.08 
 
 		 153 aa  174  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  53.38 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  58.78 
 
 		 153 aa  170  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  55.41 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  55.41 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  54.73 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  50.68 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  54.73 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  52.03 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  54.73 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  52.35 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  55.41 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  54.11 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  48.32 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  54.48 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  53.38 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  49.33 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  54.05 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  53.69 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  55.32 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  52.41 
 
 		 152 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  45.52 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  43.62 
 
 		 151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  54.05 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  43.84 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.31 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.51 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.31 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  44.59 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  41.18 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.91 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.3 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.16 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  33.78 
 
 		 146 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  41.89 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  38.46 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  37.24 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  40.15 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.6 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  35.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  36.73 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  35.57 
 
 		 513 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  37.16 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.23 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.24 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.23 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.23 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.23 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.06 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  39.01 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  34.23 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.99 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  40.71 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  35.86 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  34.78 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.24 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  37.24 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.3 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  34.69 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.86 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  33.1 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  35.81 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  35.53 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>