257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2994 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  82.99 
 
 
147 aa  245  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  78.23 
 
 
147 aa  234  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  234  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  80.95 
 
 
147 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  80.95 
 
 
147 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  80.95 
 
 
147 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  80.95 
 
 
147 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  78.91 
 
 
147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  75.51 
 
 
147 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  77.55 
 
 
147 aa  225  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  78.91 
 
 
147 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  80.27 
 
 
147 aa  197  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  79.59 
 
 
147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  63.7 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  60.96 
 
 
147 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  57.53 
 
 
147 aa  170  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  58.22 
 
 
147 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  58.22 
 
 
147 aa  167  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  55.56 
 
 
151 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  63.01 
 
 
148 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  54.79 
 
 
150 aa  157  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  54.79 
 
 
147 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  54.42 
 
 
149 aa  156  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  54.48 
 
 
152 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  55.48 
 
 
148 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  53.1 
 
 
149 aa  147  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  51.72 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  45.52 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  49.32 
 
 
147 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  48.97 
 
 
149 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  51.72 
 
 
151 aa  139  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  52.86 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  48.28 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  51.37 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  49.32 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  49.32 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  49.32 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  52.05 
 
 
148 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  50.68 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  46.53 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  48.63 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 
148 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  46.58 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  48.61 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  52.05 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  47.26 
 
 
148 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  48.55 
 
 
148 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  47.26 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  45.89 
 
 
149 aa  129  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  48.63 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  46.1 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  46.1 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  45.89 
 
 
148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  47.86 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  50 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  47.26 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  50.68 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  42.07 
 
 
148 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  44 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  50.68 
 
 
148 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  47.26 
 
 
152 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  47.26 
 
 
152 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  41.5 
 
 
148 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  41.78 
 
 
148 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  41.78 
 
 
148 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  45.03 
 
 
153 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  44.52 
 
 
148 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  43.26 
 
 
145 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  48.63 
 
 
148 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  39.46 
 
 
151 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  43.05 
 
 
152 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
148 aa  120  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  43.92 
 
 
152 aa  119  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  41.96 
 
 
149 aa  120  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  42.57 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  43.92 
 
 
153 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  43.61 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  44.83 
 
 
150 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  40.67 
 
 
152 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3781  GatB/YqeY domain-containing protein  48.63 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472621  normal  0.0350556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.06 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.16 
 
 
149 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3255  GatB/Yqey domain-containing protein  48.63 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.016428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>