259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1804 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  285  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  57.14 
 
 
150 aa  176  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  52.41 
 
 
148 aa  156  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  52.82 
 
 
148 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  47.59 
 
 
150 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  49.31 
 
 
149 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  50 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  47.59 
 
 
147 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  48.61 
 
 
149 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  42.36 
 
 
146 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  49.65 
 
 
147 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  46.53 
 
 
149 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  51.05 
 
 
147 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  50.7 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  45.83 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  50 
 
 
147 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  48.61 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  48.23 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  48.23 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
147 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  48.23 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  48.28 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.69 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  47.86 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  47.55 
 
 
149 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  47.92 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  45.39 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  42.76 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  45.52 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  42.07 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  42.96 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  47.22 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  47.22 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.6 
 
 
147 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  42.66 
 
 
147 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  43.26 
 
 
147 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  43.17 
 
 
147 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  43.15 
 
 
151 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  46.53 
 
 
149 aa  120  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  44.14 
 
 
148 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  44.44 
 
 
149 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.07 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  43.45 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  46.21 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  42.47 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  43.75 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  41.82 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  44.7 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  39.73 
 
 
150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  43.45 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 
147 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  41.73 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  45.21 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  46.38 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.45 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.73 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.69 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  41.22 
 
 
513 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.73 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.73 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.73 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42.36 
 
 
148 aa  114  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  41.01 
 
 
147 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  46.9 
 
 
147 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  42.45 
 
 
147 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  42.45 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.01 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.97 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  41.38 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  39.04 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  41.13 
 
 
148 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  39.86 
 
 
147 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  43.06 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  43.06 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  39.57 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.24 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  40.24 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.24 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  42.47 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  42.31 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.89 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  39.86 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  42.36 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>