256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1180 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  266  5e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  61.11 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  50.69 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  41.67 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  42.36 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  45.27 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  45.52 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.55 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.62 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  40.97 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.19 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  42.76 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  40.97 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  40.97 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.58 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  40.28 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  39.01 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.72 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  36.55 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  37.32 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.19 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  40.28 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  43.26 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  38.19 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  38.19 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  39.58 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  40.43 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  39.72 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  38.03 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  41.38 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  40.69 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  34.03 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  37.67 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  37.67 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  37.96 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  38.89 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  38.19 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  38 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  36.91 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  36.24 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  39.58 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  38.19 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  38.19 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  35.42 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  34.29 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  46.31 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  35.62 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  37.5 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  34.48 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  34.72 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  36.55 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.24 
 
 		 513 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  36.24 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  34 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  36.17 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  37.24 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  36.17 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  35.46 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  35.46 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  33.79 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  40.54 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  36.49 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  34.72 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  38.19 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  32.89 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2333  GatB/YqeY domain-containing protein  39.19 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  36.3 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  32.41 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  36.11 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.81 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  37.58 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  35.92 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  37.09 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>