259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0338 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  286  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  68 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  56 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  58.67 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  56.67 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  58 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  50.67 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  55.33 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  50.67 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  57.33 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  53.9 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  58.67 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  42.67 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  56 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  51.95 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  51.95 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  51.95 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  47.68 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  51.97 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  42.18 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  55.26 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.06 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  45.58 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  44.9 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  45.58 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  45.75 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  43.06 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  41.45 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  44.9 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  44.9 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  48.7 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  39.74 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  43.54 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  44 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.5 
 
 		 146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  44.97 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  36.67 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  46.05 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.97 
 
 		 151 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  41.5 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  41.5 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  35.33 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  39.46 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  37.58 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.84 
 
 		 513 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.19 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  42.57 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  36.49 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  58.2 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  39.19 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  34 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  41.33 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  37.84 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  39.71 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  41.33 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  37.33 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  37.75 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  39.86 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  43.75 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  38.82 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>