256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4563 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  100 
 
 		 160 aa  302  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  58.82 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  58.11 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  58.11 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  58.11 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  53.38 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  53.95 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  53.95 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  53.95 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  53.9 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  55.56 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  53.25 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  54.43 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  55.26 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  54.86 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  59.21 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  56.58 
 
 		 152 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  52.2 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  51.28 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  49.67 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  51.01 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  37.66 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  37.66 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  48.37 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  53.21 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  41.45 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  41.22 
 
 		 147 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.54 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.22 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  34.21 
 
 		 146 aa  97.1  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  44.74 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  56 
 
 		 151 aa  97.1  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  42.48 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  41.29 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.67 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  38.96 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.91 
 
 		 148 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  37.06 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  38.71 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  40.13 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  35.53 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  38.56 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  40.52 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  33.33 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  35.95 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.14 
 
 		 152 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  36.18 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  41.56 
 
 		 150 aa  90.9  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.87 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.26 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.71 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.26 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.53 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  39.35 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.51 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  33.77 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.51 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  39.35 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  41.94 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  39.33 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  38.71 
 
 		 151 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  38.22 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.26 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.79 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  38.31 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  35.81 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  41.18 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  35.53 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  34.72 
 
 		 148 aa  84.7  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  39.49 
 
 		 154 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  32.24 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  32.24 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  40.91 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  43.42 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  34.23 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  42.76 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  39.87 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  33.54 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  36.6 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  39.31 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  32.03 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  29.41 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.22 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  33.11 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  35.71 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  36.54 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  29.22 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>