262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4276 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  286  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  68 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  57.33 
 
 		 154 aa  163  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  58.67 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  57.62 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  52.98 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  54.9 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  60.4 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  54 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  60.4 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  54.3 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  57.52 
 
 		 184 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  55.56 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  45.45 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  52.67 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  50.99 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  43.06 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  41.67 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  49.35 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  40.14 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  45.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.18 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  42.18 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  40.79 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  41.89 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  41.89 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  41.89 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  41.72 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.78 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  34.9 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.11 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  36.91 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.23 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  38.69 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  42.48 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  34.48 
 
 		 148 aa  97.1  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  38.1 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  43.62 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  55.28 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  37.16 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  59.6 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  32.45 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  36.24 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  38.82 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  38.82 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  38.67 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  36.67 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  37.58 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  37.86 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  36.49 
 
 		 513 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  36.24 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  39.33 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  36.05 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  36 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  90.1  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  36 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  35.33 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>