257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3792 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  100 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  99.32 
 
 		 147 aa  285  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  70.07 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  64.83 
 
 		 146 aa  184  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  62.07 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  53.06 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  53.06 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  53.06 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  46.9 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  45.89 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  44.9 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  44.9 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.06 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  44.83 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  44.9 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  44.22 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  43.54 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  44.22 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  46.94 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  46.58 
 
 		 148 aa  121  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  42.18 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  42.18 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  42.76 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  43.24 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  43.15 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  43.54 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  41.67 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  43.54 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42.18 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  41.5 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  41.45 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  43.92 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  42.57 
 
 		 513 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.5 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  44.9 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  43.15 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  39.29 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  43.54 
 
 		 178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  43.54 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  41.06 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  42.47 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  43.24 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  40.14 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  46.26 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  38.16 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  41.1 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  43.36 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  39.29 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  39.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  39.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.14 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  39.19 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  39.73 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  39.73 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>