257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1347 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  100 
 
 		 147 aa  284  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  70.55 
 
 		 147 aa  201  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  65.07 
 
 		 149 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  57.53 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  53.02 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  54.05 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  52.05 
 
 		 148 aa  153  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  50.68 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  49.32 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  47.59 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  49.66 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 147 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  48.32 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  46.94 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  46.94 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  46.26 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  46.26 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  47.62 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  47.3 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  46.26 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  44.22 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  43.54 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  44.3 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.45 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  45.58 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  44.14 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  45.21 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  45.58 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  43.45 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.46 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  43.15 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  44.14 
 
 		 149 aa  120  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  43.45 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  39.73 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  41.5 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  45.27 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.5 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.69 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.1 
 
 		 149 aa  116  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42.47 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.61 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.82 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  44.37 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  43.84 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.1 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.14 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  40.41 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  37.41 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.67 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  42 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  43.15 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  38.62 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  41.38 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.47 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  38.62 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  41.22 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>