257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2279 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  294  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  294  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  45.89 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  50.68 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  53.06 
 
 		 147 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  48.97 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  46.94 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  46.62 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  48.97 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  48.28 
 
 		 147 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  48.28 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  47.22 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  47.59 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  46.98 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  47.59 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  43.45 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  42.36 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  45.52 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42.36 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  44.14 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  42.25 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  43.62 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.25 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  47.33 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  41.1 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.25 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  45.95 
 
 		 513 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.58 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  42.07 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  41.38 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  42.76 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  42.76 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.89 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  39.19 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  42.76 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  42.07 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.31 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  39.86 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  42.96 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.19 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  42.96 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  40.28 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  36.99 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  39.72 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.55 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  43.54 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  39.04 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  37.33 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  39.73 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.73 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  38.36 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  37.75 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  36.05 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  40.28 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  37.24 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  39.31 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  37.41 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  36.05 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.11 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  38 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  33.79 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  35.86 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.73 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  38.19 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  37.93 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  41.78 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  37.93 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>