258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9015 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  283  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  67.33 
 
 
154 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  64.67 
 
 
151 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  64 
 
 
167 aa  180  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  63.33 
 
 
151 aa  176  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  72.48 
 
 
155 aa  175  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  67.11 
 
 
150 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  61.44 
 
 
155 aa  156  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  58.67 
 
 
152 aa  154  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  60 
 
 
151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  59.6 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  56.67 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  140  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  53.25 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  56.58 
 
 
184 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  59.73 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  58.17 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  53.25 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  53.25 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  53.25 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  45.95 
 
 
149 aa  123  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.3 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  51.3 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  50.33 
 
 
152 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  48.28 
 
 
143 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  44.9 
 
 
146 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  43.24 
 
 
147 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  46.26 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  45.58 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  39.33 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  46.62 
 
 
149 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.82 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  45.95 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  44.59 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.57 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  44.59 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  44.59 
 
 
149 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
148 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.22 
 
 
147 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.62 
 
 
148 aa  103  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.24 
 
 
150 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  59.02 
 
 
151 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.67 
 
 
149 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.78 
 
 
150 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  42.28 
 
 
152 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 
151 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  41.61 
 
 
152 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  41.61 
 
 
152 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  35.42 
 
 
148 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.86 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40.27 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36.05 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  36.91 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40.4 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40.27 
 
 
150 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.06 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.82 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  38 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  34.23 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  33.56 
 
 
149 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  39.86 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  39.19 
 
 
513 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  35.81 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  34.93 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  41.89 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.27 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  39.19 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  41.89 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  37.58 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  37.16 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  34.23 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.89 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.14 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  36.49 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
152 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.04 
 
 
147 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 
147 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  37.91 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  36.24 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  33.11 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  37.67 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.24 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>