258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4920 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  100 
 
 
155 aa  294  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  72.19 
 
 
154 aa  207  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  67.11 
 
 
151 aa  197  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  72.48 
 
 
150 aa  196  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  68 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  69.33 
 
 
167 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  68.46 
 
 
150 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  61.29 
 
 
155 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  63.4 
 
 
154 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  60.4 
 
 
152 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  62.42 
 
 
151 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  58.67 
 
 
152 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  56.38 
 
 
150 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  54.36 
 
 
150 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  59.6 
 
 
184 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  60.93 
 
 
155 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.65 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  44.97 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  48.63 
 
 
146 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  51.3 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  51.3 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  51.3 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  47.26 
 
 
146 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  51.01 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  59.21 
 
 
160 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  47.95 
 
 
147 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  51.95 
 
 
154 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  47.26 
 
 
147 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  40 
 
 
148 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  46.9 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  41.22 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  44.97 
 
 
149 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
151 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  43.24 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  111  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  111  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.47 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.95 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  42.28 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  38.62 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.51 
 
 
150 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  38.85 
 
 
146 aa  107  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  42.18 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  44 
 
 
152 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
148 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  37.24 
 
 
149 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  104  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  41.5 
 
 
149 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  41.5 
 
 
149 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40.27 
 
 
148 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  36.55 
 
 
149 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
148 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  39.26 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  39.86 
 
 
152 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  36.88 
 
 
149 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  38.26 
 
 
148 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  41.01 
 
 
152 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  41.45 
 
 
149 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  37.86 
 
 
147 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  39.72 
 
 
148 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  38.13 
 
 
147 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  41.38 
 
 
151 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  100  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  37.84 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.26 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  39.6 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.78 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  38.51 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.36 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  38.51 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  36.99 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  36.99 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  36.42 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  40.28 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  39.58 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.73 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  39.6 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  41.22 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>