258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25460 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  289  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  56.67 
 
 
167 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  54.67 
 
 
151 aa  157  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  56.41 
 
 
155 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  54.67 
 
 
151 aa  151  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  54.67 
 
 
154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  56.38 
 
 
155 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  52 
 
 
152 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  54.67 
 
 
150 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  45.89 
 
 
149 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  46.67 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
154 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  44.87 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  47.33 
 
 
150 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  52.29 
 
 
155 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  48.7 
 
 
154 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  48.7 
 
 
154 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  48.7 
 
 
154 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  51.59 
 
 
160 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.51 
 
 
150 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  43.71 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  43.15 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  46.9 
 
 
143 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  38 
 
 
148 aa  114  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  41.5 
 
 
147 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  51.95 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  41.5 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.65 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  42.18 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  38.51 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  41.5 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  39.46 
 
 
146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40.82 
 
 
146 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  36.73 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  41.91 
 
 
147 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  39.19 
 
 
149 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  42.95 
 
 
152 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  39.73 
 
 
151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.86 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  107  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  44.9 
 
 
149 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  39.6 
 
 
152 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  39.6 
 
 
152 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.54 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.6 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  44.22 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  58 
 
 
151 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.82 
 
 
149 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  38.19 
 
 
147 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  37.41 
 
 
147 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  38.93 
 
 
152 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  36.36 
 
 
148 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  39.73 
 
 
147 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.73 
 
 
147 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.49 
 
 
148 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 
147 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  104  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
148 aa  103  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 
146 aa  103  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  40.94 
 
 
150 aa  103  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  38.36 
 
 
148 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  36.69 
 
 
146 aa  103  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  42.47 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  40.67 
 
 
152 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  41.1 
 
 
148 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 
151 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  40.54 
 
 
149 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  36.81 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  36.81 
 
 
147 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>