255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0625 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  100 
 
 		 152 aa  293  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  99.34 
 
 		 152 aa  292  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  95.39 
 
 		 152 aa  278  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  68.42 
 
 		 153 aa  207  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  75.5 
 
 		 152 aa  190  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  74.83 
 
 		 152 aa  190  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  56.38 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  56.29 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  57.72 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  55.41 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  53.69 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  63.33 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  56.95 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  56 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  56.38 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  56.29 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  55.33 
 
 		 154 aa  153  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  52.67 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  51.66 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  53.69 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  58.62 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  52.32 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  56.74 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  53.02 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  52.35 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  53.69 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  53.69 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  52.35 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  54.36 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  47.02 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  53.33 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  52.94 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  45.33 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  44.97 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  44 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  44.67 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  46.31 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  46 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  46 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  42 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  48.3 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  42 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  45.33 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.38 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.33 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.33 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.3 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.07 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  48.32 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.61 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  44.93 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  48.92 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  41.61 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  44.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  45 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  43.62 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  40.67 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  44.14 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  39.35 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  44.97 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.6 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  43.62 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  42.07 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  44.97 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.86 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.61 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  41.06 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  43.84 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  43.84 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>