257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1860 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  288  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  66.23 
 
 
152 aa  173  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  60.53 
 
 
150 aa  164  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  47.44 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  47.71 
 
 
151 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  44.9 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  45.95 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  46.41 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  42.18 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  43.79 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.07 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  50.68 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  44.74 
 
 
143 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  44.44 
 
 
151 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  42.47 
 
 
146 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  42.38 
 
 
154 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 
154 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  45.03 
 
 
154 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.07 
 
 
149 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  46.5 
 
 
154 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 
154 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  45.1 
 
 
155 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  40.94 
 
 
513 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  41.94 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  46.21 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  42.38 
 
 
155 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.6 
 
 
148 aa  97.1  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.1 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  37.16 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.47 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.16 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  38.56 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.56 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  37.75 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.4 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.09 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  42.48 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  41.45 
 
 
147 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  41.78 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.18 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  36.6 
 
 
149 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  38.31 
 
 
152 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  37.41 
 
 
146 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  38.82 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  36.18 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  43.59 
 
 
184 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  39.07 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.87 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  37.09 
 
 
148 aa  90.9  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  38.93 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  42.98 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  39.47 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.16 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.84 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  37.01 
 
 
151 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  40.13 
 
 
147 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  34.44 
 
 
147 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.82 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.41 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40.13 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0631  GatB/YqeY domain-containing protein  35.71 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0689241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  39.47 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  42.95 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.47 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  38.16 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.09 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  37.06 
 
 
149 aa  87  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  37.33 
 
 
152 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  33.56 
 
 
145 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  35.53 
 
 
147 aa  87  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  36.84 
 
 
147 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  37.33 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  36.73 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.47 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  36 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  38.82 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  32.24 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  37.75 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  38.16 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  39.47 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  31.58 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38.82 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  36.67 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38.82 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>