257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1367 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  291  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  72.6 
 
 
148 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  59.46 
 
 
151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  61.07 
 
 
178 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  53.38 
 
 
148 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  47.26 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  47.26 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  45.21 
 
 
149 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  45.21 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  45.21 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  47.26 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  45.27 
 
 
149 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  47.26 
 
 
147 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  44.52 
 
 
147 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  45.95 
 
 
158 aa  120  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  44.22 
 
 
147 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  45.39 
 
 
151 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 
147 aa  120  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.47 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  42.96 
 
 
147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.06 
 
 
146 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  44.37 
 
 
513 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  42.66 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  42.18 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  41.5 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  41.78 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  43.84 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  40.14 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  40.82 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  37.24 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  43.06 
 
 
152 aa  111  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  41.5 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  40.82 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 
149 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  38.67 
 
 
151 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.78 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  38.13 
 
 
150 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 
150 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  41.48 
 
 
147 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  42.57 
 
 
148 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.44 
 
 
150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 
148 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  40.56 
 
 
148 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  43.66 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  44.22 
 
 
148 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  40.41 
 
 
148 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  38.51 
 
 
149 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  40.74 
 
 
147 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
148 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1512  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.486717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  39.87 
 
 
153 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  37.67 
 
 
147 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.96 
 
 
145 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  44.19 
 
 
149 aa  103  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  40 
 
 
147 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 
147 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.25 
 
 
148 aa  102  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  42.47 
 
 
148 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  40 
 
 
147 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.47 
 
 
152 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  41.96 
 
 
151 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  38.35 
 
 
149 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  37.93 
 
 
149 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  41.78 
 
 
149 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  37.93 
 
 
149 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  42.14 
 
 
152 aa  100  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  39.73 
 
 
149 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  39.26 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.55 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  39.29 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  42.11 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  35.62 
 
 
148 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>