255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1088 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  61.33 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  57.33 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  58.78 
 
 		 148 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  49.33 
 
 		 148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  45.03 
 
 		 513 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  38.93 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.54 
 
 		 147 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  40.54 
 
 		 149 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  43.62 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  40.54 
 
 		 149 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  39.19 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  43.92 
 
 		 151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.54 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  42 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  42 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.28 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  41.5 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  39.07 
 
 		 152 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.33 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.1 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  39.46 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.41 
 
 		 149 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.81 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  36.91 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  35.33 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38.26 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38.26 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  41.83 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  40.29 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.07 
 
 		 150 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  38.69 
 
 		 146 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.91 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  38.51 
 
 		 152 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  36.91 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.58 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  40.56 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  39.19 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.18 
 
 		 148 aa  98.6  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.19 
 
 		 147 aa  98.6  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  37.8 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  36.24 
 
 		 147 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  39.74 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 		 150 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  97.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40.77 
 
 		 153 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.27 
 
 		 148 aa  97.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  37.8 
 
 		 149 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  39.07 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 147 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  37.01 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  39.35 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  38.16 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  36.36 
 
 		 147 aa  95.9  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  41.22 
 
 		 148 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  37.84 
 
 		 151 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  34.46 
 
 		 149 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  34.46 
 
 		 149 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  35.42 
 
 		 147 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>