257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2386 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  64.47 
 
 		 152 aa  199  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  63.16 
 
 		 154 aa  176  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  60.26 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  60.26 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  52.29 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  56 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  55.33 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  54.97 
 
 		 150 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  61.97 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  58.17 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  54.67 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  50.33 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  50.34 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  48.67 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  51.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  53.33 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  51.33 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  49.01 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  51.33 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  50.98 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  50.99 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  45.89 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  51.01 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  45.03 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  45.03 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  49.01 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  46.36 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  44.37 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  44.08 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  117  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  47.02 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.67 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  49.33 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  47.33 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  44.44 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.74 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  42.38 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  50 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  42.38 
 
 		 147 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  41.72 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  45.03 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.07 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  41.72 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  40.4 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  44.08 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  40.13 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.13 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  40.13 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  40.13 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  41.83 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  37.91 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.16 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.79 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  41.33 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  42.48 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  38.56 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  35.95 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.67 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  39.47 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  40.13 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  39.87 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  38.82 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  47.02 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  47.02 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  40.13 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.16 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  37.34 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  37.09 
 
 		 513 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.84 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  36 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  37.76 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  46.36 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  40.13 
 
 		 148 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  36.84 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>