257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1727 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  290  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  53.64 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  52 
 
 		 513 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  50.99 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  49.67 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  51.66 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  49.01 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  49.67 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  48.34 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  49.33 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  48 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  47.37 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  44.67 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  47.33 
 
 		 149 aa  130  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  44.37 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  42.38 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  44 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  45.39 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  39.47 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  44.67 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  39.74 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  41.06 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  45.1 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  39.74 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  45.03 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  45.03 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  47.33 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  41.72 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  43.14 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  39.74 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  40.79 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  42.11 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  48.23 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  44.3 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  39.74 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  39.33 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  39.74 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  46.85 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  42.18 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  42.18 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  43.71 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.82 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  39.07 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  40.4 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  36.84 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.52 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  40.85 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  43.05 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  43.62 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.33 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  40.79 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  39.33 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  44.59 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  43.42 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  45.27 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  44 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  41.06 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  41.33 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  38.67 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  39.74 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  43.42 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.74 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  43.62 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  42.76 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  44.22 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  40.38 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  39.47 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.26 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  41.06 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  45.27 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  42.11 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  41.72 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  41.72 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>