256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0732 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  288  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  51.02 
 
 
148 aa  152  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  53.42 
 
 
147 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  52.74 
 
 
147 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  48.3 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  49.66 
 
 
148 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  48.28 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  49.66 
 
 
143 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  44.37 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  45.58 
 
 
148 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  45.58 
 
 
147 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.18 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  43.54 
 
 
148 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  42.38 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  44.06 
 
 
148 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  42.95 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  45.21 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  41.72 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  41.96 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.82 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  40.54 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  41.38 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  42.66 
 
 
148 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  45.58 
 
 
148 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  44.37 
 
 
149 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
149 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  37.09 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  40.14 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  38.36 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  39.73 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  42.18 
 
 
148 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  41.73 
 
 
148 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  40.13 
 
 
153 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  40.4 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  40.14 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  40.14 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  41.45 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.04 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  40.14 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  37.67 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  39.07 
 
 
157 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.99 
 
 
151 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  37.24 
 
 
149 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  40.82 
 
 
148 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  40.82 
 
 
513 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  42.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  41.5 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  36.73 
 
 
147 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  36.99 
 
 
149 aa  104  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
147 aa  104  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  36.3 
 
 
149 aa  104  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  41.73 
 
 
143 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
148 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  44.06 
 
 
147 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  37.09 
 
 
152 aa  103  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  35.86 
 
 
152 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  36.05 
 
 
148 aa  103  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 
150 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  38.46 
 
 
147 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.76 
 
 
147 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  35.62 
 
 
149 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 
148 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  39.55 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  39.55 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  39.04 
 
 
148 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  36.88 
 
 
146 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  34.93 
 
 
149 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  37.41 
 
 
148 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.81 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  39.55 
 
 
147 aa  101  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  39.46 
 
 
167 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>